É celebrado um Protocolo entre o Ministério da Defesa Nacional e o Ministério das Obras Públicas, Transporte e Habitação para a utilização da infraestrutura aeronáutica da Base Aérea n.º 11, em Beja, por aeronaves civis. Em março de 2004, foram adjudicados os projetos de execução das especialidades do lado terra, das áreas operacionais, terraplenagens gerais, arruamentos e estacionamentos da futura componente civil. Em setembro de 2006, o dono da obra adjudicou os projetos de engenharia e arquitectura, por concurso público com publicitação internacional, para a elaboração dos projetos de execução dos edifícios da 1.ª fase do Plano de Desenvolvimento do aeroporto de Beja. Neste contrato estavam compreendidos os edifícios do terminal de passageiros, do terminal de carga, o edifício de serviços, o edifício dos bombeiros, o edifício de material de carga e o edifício da portaria. O aeroporto viria a ser inaugurado em 2011, tendo alcançado um êxito muito reduzido na captação de voos.